Les fonctions décisionnelles n'échappent pas à cette tendance et tout ERP sérieux se doit d'avoir un module de reporting. Un module décisionnel intégré est une solution adaptée pour des réponses rapides à des requêtes standards. Mais une application décisionnelle à l'échelle de l'entreprise exige des moyens adaptés, en particulier la création d'un entrepôt de données (ou datawarehouse) spécifique, forcément distinct de la base de données de production. Et l'application décisionnelle peut revendiquer à son tour d'être une plate-forme d'intégration des données provenant de toutes les applications de l'entreprise.
Enfin, certains domaines applicatifs sont trop spécifiques pour être intégrés dans un ERP. Ainsi le domaine de la production utilise des logiciels de type MES qui manipulent des informations liées à la fabrication. La question pertinente devient alors celle du format des données et de l'interconnexion entre les diverses applications de l'entreprise, y compris son ou ses ERP. Mais l'ERP ne serait-il pas tenté à nouveau d'absorber ces catégories d'applications ? S'il est toujours possible de définir une interface utilisateur commune, l'intérêt de l'intégration au niveau plus fin de la logique applicative reste à prouver.
